وي روايات بحار الأنوار را در 25 جلد، تنظيم کرده است. هر جلد، حاوي رواياتي است که با عنوان اصلي کتاب و عنوان هاي فرعي، از هم جدا مي شود. ترتيب کتب، به ترتيب مجلّدات قديم و جديد (داخل پرانتز) چنين است:

يک. عقل و جهل (جلدهاي 1 ـ 2)؛

دو. توحيد و اسماي حُسني (جلدهاي 3 ـ 4)؛

سه. عدل و معاد (جلدهاي 5 ـ 8)؛

چهار. احتجاجات و مناظرات (جلدهاي 9 ـ 10)؛

پنج. نبوّت و قصّه هاي انبيا (جلدهاي 11 ـ 14)؛

شش. شرح حال پيامبر اسلام (جلدهاي 15 ـ 22)؛

هفت. امامت (جلدهاي 23 ـ 27)؛

هشت. فتنه هاي پس از پيامبر(ص) (جلدهاي 28 ـ 34)؛

نُه. زندگي امير مؤمنان (عليه اسلام)(جلدهاي 35 ـ 42)؛

ده. زندگاني حضرت فاطمه، امام حسن و امام حسين(عليهم اسلام) (جلدهاي 43 ـ 45)؛

يازده. زندگاني امام سجاد، امام باقر، امام صادق و امام کاظم (عليهم اسلام)(جلدهاي 46 ـ 48)؛

دوازده. زندگاني امام رضا، امام جواد، امام هادي و امام عسکري (عليهم اسلام)(جلدهاي 49 ـ 50)؛

سيزده. زندگاني امام زمان (عج) (جلدهاي 51 ـ 53 و جلدهاي 54 ـ 56، شامل فهارس است که سيّد هدايت مسترحمي، آن را ترتيب داده و در ضمن مجموعه ي بحار الأنوار، به چاپ رسيده است)؛

چهارده. السماء و العالم: شامل مباحث: عرش، کرسي، ملائکه، جن، انس، حيوانات، زمان و مکان، شکار خوردني ها و نوشيدني ها، طبّ افلاک، عناصر، و حدوث (جلدهاي 57 ـ 66)؛

پانزده. ايمان و کفر (جلدهاي 67 ـ 73)؛

شانزده. آداب و سنن (جلدهاي74 ـ 76)؛

هفده. مواعظ و حِکَم (جلدهاي 77 ـ 78)؛

هجده. طهارت و صلات (جلدهاي 79 ـ 91)؛

نوزده. قرآن و ادعيه (جلدهاي 92 ـ 95)؛

بيست. زکات، صدق، خمس، صوم، اعتکاف و اعمال ماه ها (جلدهاي 96 ـ 98)؛

بيست و يک. حج و عمره، جهاد، امر به معروف و نهي از منکر (جلدهاي 99 ـ 100)؛

بيست و دو. مزار (جلدهاي 100 ـ 102)؛

بيست و سه. عقود و ايقاعات (جلدهاي 103 ـ 104)؛

بيست و چهار. احکام شرعيه: شامل ديات، قصاص، حدود و... (ادامه ي جلد 104)؛

بيست و پنج. اجازات (جلدهاي 105 ـ 110)؛
در مجموع، بحار الأنوار، دارايِ 44 کتاب و 2489 باب است.